More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0082 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  57.73 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  34.34 
 
 
170 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.14 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.61 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  31.13 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.26 
 
 
177 aa  84.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.82 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.65 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.5 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.44 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  31.35 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.53 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.35 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.7 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.04 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.38 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.18 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.64 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.72 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.6 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.64 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.41 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  28.93 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.86 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.53 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
167 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.61 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.64 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  31.63 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  30.26 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.53 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  31.74 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  24.74 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.32 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.93 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.34 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  27.09 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.73 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.26 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  33.89 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.22 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.41 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.52 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.13 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.23 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.41 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  26.26 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.53 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.45 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.62 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  28.57 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.32 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.04 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  31.08 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.61 
 
 
174 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.74 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.09 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.43 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.25 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.29 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.13 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.46 
 
 
169 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  31.87 
 
 
169 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.93 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.96 
 
 
169 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.47 
 
 
169 aa  62.4  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  27.5 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  23.71 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.64 
 
 
176 aa  61.6  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.26 
 
 
191 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.93 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.76 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.76 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.22 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.57 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  21.05 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  26.84 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1054  nitroreductase family protein  28.88 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.72 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  28.3 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.72 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.43 
 
 
584 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.94 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0993  nitroreductase family protein  29.28 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.81 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.37 
 
 
174 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.33 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  30 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>