More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1241 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  78.49 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  79.26 
 
 		 188 aa  307  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  73.91 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  71.89 
 
 		 186 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  50.54 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  47.31 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  50 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  48.91 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  44.02 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  44.02 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  39.56 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  40.96 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.7 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  36.84 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  38.55 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.64 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.05 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.52 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.68 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.68 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.33 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.94 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.04 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.08 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.16 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.97 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  37.37 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  37.35 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  35.29 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  33.15 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  35.11 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  34.66 
 
 		 278 aa  95.5  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.77 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  35.64 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  35.64 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.29 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.51 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.83 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.29 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.29 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.55 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  31.91 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.61 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  34.43 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.91 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.12 
 
 		 175 aa  90.9  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.38 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.75 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.91 
 
 		 167 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  29.51 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.39 
 
 		 170 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.07 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.43 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32.62 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.91 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.73 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.11 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  35.52 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.51 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.09 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.26 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.61 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  33.15 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  32.35 
 
 		 172 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.52 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  32.35 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.43 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.94 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  31.52 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.52 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.96 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  30.43 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.63 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  25.87 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.54 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  34.27 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  34.5 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.65 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.4 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.5 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1996  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.76 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.5 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  29.05 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.84 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.61 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.38 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  29.35 
 
 		 273 aa  80.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.85 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  31.84 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  34.9 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.9 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.81 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.73 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.59 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.65 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>