More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0528 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  53.66 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  51.27 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  34.04 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  34.04 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  31.44 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  34.92 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  34.69 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  34.33 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  34.25 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  35.8 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  32.26 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  34.66 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  34.66 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  34.66 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  34.66 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  32.8 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  31.94 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  33.52 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  29.85 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  32.84 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  33.51 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  31.32 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  32.84 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  32.84 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  30.65 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  32.84 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  32.64 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  31.18 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  31.61 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  28.77 
 
 		 265 aa  92  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  31.61 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  31.61 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  32.12 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  29.95 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  32.84 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.3 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.38 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  31.47 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  29.57 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.09 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  31.89 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  32.64 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.12 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  29.95 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.2 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  28.97 
 
 		 220 aa  84.7  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  30.14 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  30.14 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.64 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.19 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  29.95 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.02 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  30.17 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  28.71 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.71 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  26.76 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  25.27 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.59 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.57 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  25.53 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  28.71 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.71 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.71 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  28.24 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  26.89 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  29.95 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.55 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  26.89 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.69 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  31.31 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  25.51 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  25.39 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  25.51 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  26.6 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  25 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  27.31 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.61 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.13 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.37 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  30.16 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  25.84 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.1 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  25.68 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  29.06 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.22 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  29.19 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.73 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.37 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>