More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1379 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  100 
 
 
174 aa  362  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  60.95 
 
 
169 aa  225  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  61.54 
 
 
169 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  52.91 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  54.22 
 
 
166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  54.44 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  53.61 
 
 
166 aa  194  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  47.93 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  53.49 
 
 
174 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  57.99 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  46.43 
 
 
173 aa  173  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  46.15 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  46.43 
 
 
173 aa  170  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  47.65 
 
 
173 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  45.56 
 
 
169 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  46.43 
 
 
173 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  50 
 
 
170 aa  166  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  44.97 
 
 
169 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  44.64 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  46.3 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  46.75 
 
 
169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  47.59 
 
 
169 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  44.63 
 
 
187 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  40 
 
 
201 aa  148  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  36.14 
 
 
166 aa  137  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.87 
 
 
171 aa  134  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.71 
 
 
197 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  39.53 
 
 
274 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  36.53 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.8 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  36.9 
 
 
169 aa  117  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  36.26 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  34.25 
 
 
187 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.14 
 
 
165 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  38.2 
 
 
194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  37.97 
 
 
170 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  37.64 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  38.82 
 
 
167 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  35.8 
 
 
182 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.11 
 
 
186 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  35.2 
 
 
178 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  34.46 
 
 
175 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  35.5 
 
 
169 aa  104  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.9 
 
 
173 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  35.63 
 
 
184 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36.65 
 
 
170 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.04 
 
 
186 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.98 
 
 
186 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  33.94 
 
 
176 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.77 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  31.82 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.75 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.58 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.81 
 
 
171 aa  97.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  37.97 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.48 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.7 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.7 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.71 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.11 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.57 
 
 
180 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.12 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  32.76 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.16 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  32.95 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.94 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.9 
 
 
185 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.71 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  39.63 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  34.48 
 
 
172 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.8 
 
 
189 aa  91.3  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.48 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.09 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.27 
 
 
204 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  36.88 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.33 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  33.91 
 
 
189 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  34.07 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.76 
 
 
172 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  35.06 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.77 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.26 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  28.73 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.84 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.89 
 
 
278 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.77 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  34.18 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  33.51 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  38.12 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.71 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.57 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.99 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  31.07 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  34.44 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.2 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.25 
 
 
584 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  31.82 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.74 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>