More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1353 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  57.99 
 
 		 174 aa  210  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  57.99 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  53.12 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  58.58 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  47.27 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  51.48 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  46.67 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  46.99 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  43.2 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  44.38 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  44.38 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  43.79 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  43.79 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  46.3 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  42.51 
 
 		 169 aa  160  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  43.83 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  44.79 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  46.47 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  43.83 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  42.58 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  37.13 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  41.32 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  37.42 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  39.18 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  39.16 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  41.14 
 
 		 274 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  35.39 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  35.67 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.78 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  35.26 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  37.5 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  34.68 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.74 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  33.52 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  35.8 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  38.06 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  38.51 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.09 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  33.52 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.94 
 
 		 187 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.73 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.16 
 
 		 177 aa  97.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.58 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.18 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  34.74 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  33.9 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  34.74 
 
 		 214 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  37.11 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.32 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.58 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.55 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  30.64 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.92 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.66 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.42 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  40.43 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.05 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.18 
 
 		 186 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  32.08 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  34.08 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.71 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  37.28 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.64 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.22 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.93 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  36.77 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.87 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.79 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  33.79 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.81 
 
 		 584 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  39.58 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.9 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.44 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  32.73 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.39 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.65 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.95 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.69 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.14 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.68 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.85 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.72 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  28.48 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.58 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  32.5 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.09 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.38 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.39 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.66 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.57 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.94 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  41.96 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  32.16 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.16 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>