More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2164 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  53.33 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  55.03 
 
 
190 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  55.38 
 
 
195 aa  200  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  36.87 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.96 
 
 
178 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  35.39 
 
 
187 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.28 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.14 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  35.16 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  34.59 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.26 
 
 
174 aa  97.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.72 
 
 
170 aa  97.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  32.99 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  32.99 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  32.99 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  32.99 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35.91 
 
 
168 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.52 
 
 
170 aa  96.3  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  33.16 
 
 
215 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  32.47 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  32 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  32.47 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  31.96 
 
 
215 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.52 
 
 
163 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  29.86 
 
 
215 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  31.96 
 
 
215 aa  92  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.08 
 
 
178 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  32.4 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.67 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.07 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  30.77 
 
 
212 aa  89  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  33.73 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.2 
 
 
176 aa  87.8  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  27.14 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  37.57 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.98 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.42 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.42 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.52 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.98 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.32 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.82 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32.8 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.94 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.53 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  31.47 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  31.47 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  32.37 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.63 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.87 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  32.8 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  31.75 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.94 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  29.38 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.65 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.33 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  28.21 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.93 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.65 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
982 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.3 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.05 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.18 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  32.14 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.35 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.65 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.11 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.5 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.92 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.44 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.32 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.21 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  32.12 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  29.26 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.88 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.59 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  31.95 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  26.7 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  25 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  32.34 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.8 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  33.5 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.23 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.34 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  32.8 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  33.15 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.16 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  27.37 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.97 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  35.03 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.25 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.37 
 
 
280 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.43 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0087  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.6 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  35.03 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.78 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  31.58 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.37 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>