More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0310 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  44.91 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  39.16 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  38.55 
 
 
170 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  36.31 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  36.81 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  37.2 
 
 
176 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  39.29 
 
 
172 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  35.93 
 
 
163 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  36.75 
 
 
171 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.67 
 
 
176 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.08 
 
 
186 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.93 
 
 
168 aa  101  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  34.73 
 
 
178 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  35.06 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.08 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.46 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  36.99 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.67 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  34.71 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.12 
 
 
178 aa  94  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.76 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.14 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.72 
 
 
163 aa  90.9  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.13 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.9 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.58 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  35.59 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  35.48 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30.34 
 
 
209 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.03 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.76 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.83 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  35.33 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.75 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.01 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.05 
 
 
329 aa  85.1  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.61 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.39 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  34.91 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  34.23 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  34.08 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.93 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.63 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  35.75 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.97 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.12 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.92 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.57 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  34.64 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  32.2 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  32.2 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.21 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  32.1 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.36 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  35.06 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  35.06 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  35.06 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  35.06 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  35.06 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  34.19 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  35.2 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  35.2 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.21 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.14 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.94 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.22 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.96 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.65 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.21 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  34.42 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  34.42 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  35.06 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.42 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.5 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  28.09 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.06 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.1 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  33.12 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.15 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  34.08 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.21 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  29.27 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.33 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.12 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.06 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  31.55 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.67 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  29.52 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  31.82 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.35 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  31.25 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  32.32 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.09 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  32.87 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  32.6 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.38 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  34.3 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 
330 aa  71.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  28.57 
 
 
348 aa  71.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>