More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3612 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  99.5 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  99.5 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  97 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  85 
 
 		 201 aa  343  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  85 
 
 		 201 aa  343  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  84.5 
 
 		 201 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  83.5 
 
 		 207 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  85 
 
 		 201 aa  339  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  83.76 
 
 		 201 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  82.5 
 
 		 201 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  78.17 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  76.14 
 
 		 197 aa  318  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  76.14 
 
 		 205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  50.76 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  53.77 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  44.16 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  42.13 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  43.81 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  41.49 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  45.1 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  45.08 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  40.1 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  40.1 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  40.1 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  39.15 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.32 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.3 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  35.83 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  35.64 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  40.76 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  38.95 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  41.21 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.9 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  40.84 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  40.2 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  40.44 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  37.7 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  36.22 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  39.53 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  39.2 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  39.2 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  41.3 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  38.8 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  41.9 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  37.7 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  36.79 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  40.64 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  37.5 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  38.5 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  46.01 
 
 		 233 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  36.88 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  36.98 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  38.67 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  38.83 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  37.3 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.94 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.64 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  43.38 
 
 		 151 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  36.31 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  39.77 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  37.87 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  46.63 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  46.63 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  34.07 
 
 		 321 aa  98.6  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  35.8 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.07 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  33.52 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  36.07 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  39.89 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  36.02 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.62 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  34.07 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.53 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  34.2 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.41 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.87 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.01 
 
 		 174 aa  84.7  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.76 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  30.81 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.06 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.01 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  37.82 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.11 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  31.25 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.69 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.38 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.89 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.04 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.16 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.38 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  36 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.96 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.92 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  34.64 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>