More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2524 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  100 
 
 		 211 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  54.07 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  44.93 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  36.49 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  35.1 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  35.1 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  35.1 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  35.1 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  35.58 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  34.62 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  34.13 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  31.43 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  31.66 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  28.64 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  31.37 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  34.33 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  31.89 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  31.89 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  31.89 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  31.89 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  31.89 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  31.35 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  33.33 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  28.11 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.58 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  27.03 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  31.52 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.35 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  29.89 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  29.35 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  30.43 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28.8 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  28.8 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  28.8 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  29.28 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  26.88 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.49 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  28.11 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  28.26 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.49 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.87 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  30.43 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  24.48 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  28.34 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  32.62 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  26.49 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  28.49 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  28.87 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  26.7 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  25.52 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.84 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  23.12 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  22.63 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  27.43 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  25.41 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  28.18 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.65 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  25.65 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  24.15 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  24.89 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  28.37 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  23.83 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.96 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.79 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  25 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  22.83 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  26.18 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  26.29 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  26.39 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  23 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  24.76 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  25.34 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  24.89 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  26.7 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  25 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  25.93 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  25.93 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  23.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  28.11 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  23.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  26.67 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  25.93 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  26.51 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  25.95 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  25.93 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  22.6 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  21.7 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  24.61 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.24 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>