More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3107 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  100 
 
 
211 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  52.74 
 
 
204 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  51.78 
 
 
204 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  50.5 
 
 
214 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  48.24 
 
 
204 aa  207  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  39.52 
 
 
211 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  42.35 
 
 
205 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  39.42 
 
 
211 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  39.49 
 
 
213 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  36 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  33.67 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  33.17 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  33.17 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  33.17 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  33.17 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  33.82 
 
 
208 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  36.73 
 
 
212 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  32.66 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  32.18 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  34.17 
 
 
200 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  35.15 
 
 
200 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  31.68 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  34 
 
 
199 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  34.8 
 
 
213 aa  118  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  34.5 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  30.05 
 
 
213 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  33.33 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  32.8 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  35.45 
 
 
202 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
205 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  35.1 
 
 
200 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  34.31 
 
 
202 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  30.85 
 
 
204 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  104  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  29.8 
 
 
202 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  29.05 
 
 
212 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  29.05 
 
 
212 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.05 
 
 
212 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  34.13 
 
 
200 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  30.5 
 
 
205 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  28.1 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  28.1 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  57.14 
 
 
395 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  27.86 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  31.94 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  31.28 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.31 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  29.11 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  26.7 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  30.17 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  25.73 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  26.46 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.46 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  27.62 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  26.7 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  23.35 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.91 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  24.66 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  28.42 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  26.5 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  26.5 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  26.79 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  31.11 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  31.56 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.83 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  35.03 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  23.77 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  25.5 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  29.03 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.47 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  25 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  21.76 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  23.92 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  21.97 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  21.97 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  23.92 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  21.97 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  28.22 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  24.89 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.54 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.83 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  27.85 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  25.24 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  29.17 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.07 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  21.52 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.18 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  31.34 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.26 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>