More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1405 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  59.5 
 
 		 200 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  53.47 
 
 		 202 aa  225  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  49.5 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  49.5 
 
 		 200 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  49 
 
 		 200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  49 
 
 		 202 aa  217  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  49.5 
 
 		 200 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  48 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  51.76 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  45.5 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  46 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  47 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  46.5 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  42.5 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  39.3 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  32.66 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  32.09 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  30.85 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  30 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  31.03 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  32.07 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.51 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  29.67 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  26 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  26 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  26 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  26 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  31.61 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  30.77 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  26.87 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.78 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  33.51 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  30 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.85 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  27.07 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.84 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  29.61 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  31.82 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  34.97 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  23.4 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  29.74 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  32.18 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  22.7 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  22.16 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  24.35 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  28.49 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  23.68 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.41 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  23.89 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  23.2 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  24.17 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  28.8 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.23 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.14 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.23 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.2 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  23.71 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.46 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  29.01 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  30.6 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  27.46 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.4 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  23.37 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  29.09 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  23.88 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  24.27 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  20.94 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  20.94 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  24.5 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  25.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  23.15 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.39 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  24.5 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  25.37 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  26.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  24.88 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.57 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.89 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  19.9 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  30.16 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  32.18 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.5 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.13 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  25 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.5 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.73 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>