212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0250 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  100 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  55.61 
 
 
219 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  53.67 
 
 
219 aa  236  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.93 
 
 
227 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  47.47 
 
 
226 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  47.93 
 
 
227 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.47 
 
 
227 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.47 
 
 
227 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  47.47 
 
 
227 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  47.93 
 
 
227 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  47.47 
 
 
227 aa  225  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  46.08 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  48.17 
 
 
223 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  48.17 
 
 
223 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  46.12 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  46.54 
 
 
223 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  42.59 
 
 
220 aa  191  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  40.89 
 
 
235 aa  184  9e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  38.6 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  38.16 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  41.28 
 
 
211 aa  164  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  39.37 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  40.28 
 
 
208 aa  148  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  40.55 
 
 
208 aa  148  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  40.1 
 
 
220 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  42.06 
 
 
209 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  36.49 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  37.16 
 
 
209 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  42.01 
 
 
206 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  38.16 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  35.35 
 
 
219 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  36.82 
 
 
215 aa  121  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  34.17 
 
 
215 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  30.88 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.41 
 
 
214 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.51 
 
 
215 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.88 
 
 
208 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  30.73 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  29.44 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  30.3 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.23 
 
 
200 aa  94  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  29.81 
 
 
206 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  29.52 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  30.3 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  27.65 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  31.17 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
201 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.98 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  30.85 
 
 
211 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  29.85 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  30.21 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  29.11 
 
 
224 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  30.69 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  30.46 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  28.84 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  28.9 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  32 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  27.5 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.64 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  28.25 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  29.74 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  29.63 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  29.63 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  28.64 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  29.63 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  29.63 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  31.68 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  28.9 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  33.83 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  31.55 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  27.86 
 
 
217 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  29.15 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.35 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  27.86 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.77 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  28.51 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  29.7 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.25 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  27.86 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  29.69 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  28.26 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  25.69 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  28.06 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  29.9 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  30.58 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  30.68 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl289  DAD(P)H nitroreductase  29.36 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0826737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  29.74 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  30.73 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  27.06 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.35 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  26.9 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.06 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.27 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  27.07 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  28.7 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  28.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  28.18 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  26.64 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>