227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0196 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  61.5 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  62.68 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  58.17 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  53.85 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  58.37 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  56.25 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  50.48 
 
 		 232 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  48.08 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  42.93 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  45.54 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  42.58 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  45.18 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  40.2 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  37.86 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  34.15 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  38.12 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  35.86 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  39.42 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  35.96 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  34.67 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  36.32 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  36.6 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  37.06 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  36.11 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  34.21 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  33.51 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  32.06 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.46 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.68 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.46 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  32.98 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.72 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.95 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.17 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.95 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  33.51 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  32.06 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  35.19 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  29.44 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  31.5 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.99 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  33.49 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.94 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  32.82 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  30.95 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  28.7 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  30.29 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.09 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  29.17 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  29.17 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  28.24 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  28.7 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.46 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  29.9 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  29.9 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  30.28 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  30 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  29.56 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  31 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  28.11 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  29.5 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  29.56 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  31.35 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  28.92 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  26.7 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  28.86 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  28.21 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  27.65 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  28.92 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  27.98 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  33.7 
 
 		 235 aa  84.7  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.78 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.03 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  25.35 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  29.78 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  30.12 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  26.17 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  31.18 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  30.69 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  28.5 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  27.78 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  26.29 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  29.22 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  32.45 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  25.82 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  32.74 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>