More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2969 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  100 
 
 
209 aa  433  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  54.07 
 
 
211 aa  244  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  41.06 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  34.29 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  31.61 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  30.85 
 
 
206 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  33.15 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  36.02 
 
 
213 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.05 
 
 
202 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  32.97 
 
 
212 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  31.89 
 
 
205 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  31.89 
 
 
205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  31.89 
 
 
205 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
205 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  31.89 
 
 
205 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  29.56 
 
 
204 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
205 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
205 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
205 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
205 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  30.73 
 
 
199 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.44 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  31.35 
 
 
205 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  31.13 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  31.37 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  30 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  31.89 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  32.07 
 
 
205 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  30.66 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  30.39 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  30.19 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.42 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  30.19 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  27.96 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  28.34 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.33 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  30.29 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.27 
 
 
204 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  27.27 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  30.65 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  29.44 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.41 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  30 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  29.27 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  31.61 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  25 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  27.67 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  25.95 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  31.02 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  25.73 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  27.57 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.81 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28.04 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.27 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.81 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  28.22 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  28.49 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.57 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.78 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.27 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.74 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  27.66 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  25.21 
 
 
242 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  22.51 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  31.75 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.2 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.11 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  30.69 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  25.12 
 
 
226 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  24.4 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.57 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  25.32 
 
 
265 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.75 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  31.05 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.27 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.54 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  26.73 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.27 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  31.05 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.11 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  22.43 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  22.75 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  30.53 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  22.75 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  24.89 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  28.69 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  24.46 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  22.6 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.52 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>