161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05892 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 240 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  40.73 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1678  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.31 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.244515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  32.92 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  32.63 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  32.05 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  32.34 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.09 
 
 		 206 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  29.25 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  30 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  30 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  30 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  29.39 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  29.28 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  29.55 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.28 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28.64 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  27.49 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  28.64 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  26.92 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.77 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  26.29 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  27.23 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.3 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  25.96 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  23.5 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  25.34 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  28.64 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.85 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  25.76 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  25.36 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  27.66 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.63 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  25.91 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  22.22 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.61 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  26.51 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  24 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  24.52 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  26.51 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  23 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  24.88 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  26.05 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  23.04 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  22.64 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  24.88 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  24.03 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  22.77 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  26.12 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  21.92 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  24.29 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  24.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.54 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  24.89 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  24.04 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  24.78 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  25.57 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  23.74 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  25.71 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  21.98 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  26.02 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  24.22 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  23.41 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  23.21 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  24.2 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  24.56 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  22.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  22.91 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  25 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  23.4 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  25.82 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.75 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  26.36 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  26.11 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  22.46 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  22.61 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  23.41 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  24.12 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  25.44 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  21.92 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  23.94 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  21.46 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  24.12 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  26.36 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  27.48 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  26.77 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  24.27 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>