168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1060 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  89.12 
 
 
202 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  88.6 
 
 
194 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  76.44 
 
 
194 aa  307  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  74.35 
 
 
194 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  70.98 
 
 
196 aa  270  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  70.68 
 
 
196 aa  266  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  65.13 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  252  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  65.96 
 
 
194 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  63.02 
 
 
197 aa  249  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  60.31 
 
 
195 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  60.43 
 
 
196 aa  248  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  60.82 
 
 
195 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  60.31 
 
 
195 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  64.06 
 
 
197 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  60.43 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  60.43 
 
 
196 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  60.43 
 
 
196 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  60.43 
 
 
196 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  60.19 
 
 
210 aa  240  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  59.89 
 
 
196 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  59.79 
 
 
195 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  59.89 
 
 
196 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  60.31 
 
 
195 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  59.89 
 
 
196 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  58.82 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  60.51 
 
 
195 aa  231  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  58.76 
 
 
196 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  60.1 
 
 
196 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  55.44 
 
 
196 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  58.16 
 
 
201 aa  220  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  53.93 
 
 
218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  65.17 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  57.59 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  53.72 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.92 
 
 
197 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  53.99 
 
 
188 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  46.35 
 
 
201 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  44.5 
 
 
206 aa  157  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  43.65 
 
 
203 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  45.41 
 
 
208 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  41.36 
 
 
258 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  42.93 
 
 
195 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  38.97 
 
 
208 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  41.36 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  39.57 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  38.46 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  37.91 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  36.13 
 
 
201 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  33.71 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.53 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  32.18 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.29 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.55 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.55 
 
 
200 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  28.11 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.71 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  22.91 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.51 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  22.91 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  22.91 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  22.91 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  22.91 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.89 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  32.04 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  22.35 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.87 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.74 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  28.26 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  25.91 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.94 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  31.61 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  28.26 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  21.54 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  32.02 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  26.32 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  20.51 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.12 
 
 
330 aa  51.6  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.89 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  28.65 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.73 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  20.51 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  30.6 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  28.8 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  29.38 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  23.74 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  20.87 
 
 
265 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  23.66 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.73 
 
 
180 aa  47.8  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  23.78 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.26 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  28.74 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>