127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3612 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  65.99 
 
 		 196 aa  278  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  65.99 
 
 		 196 aa  278  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  65.99 
 
 		 196 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  65.48 
 
 		 196 aa  277  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  65.48 
 
 		 196 aa  277  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  64.47 
 
 		 196 aa  274  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  64.97 
 
 		 196 aa  273  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  65.48 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  63.96 
 
 		 196 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  61.46 
 
 		 196 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  63.54 
 
 		 194 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  62.18 
 
 		 194 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  63.27 
 
 		 196 aa  254  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  62.18 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  63.02 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  62.5 
 
 		 202 aa  248  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  60.71 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  59.39 
 
 		 196 aa  244  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  59.07 
 
 		 194 aa  241  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  56.35 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  53.37 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  54.92 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  54.92 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  53.37 
 
 		 195 aa  220  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  55.21 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  57.07 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  55.15 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  53.89 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  52.28 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  52.04 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  49.75 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  59.56 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  52.24 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  51.35 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  49.48 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  48.7 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  43.52 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  44.04 
 
 		 258 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  42.86 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  49.7 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  41.62 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  40.1 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  40.84 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  37.7 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  38.59 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  33.33 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  35.96 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  35.98 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  33.17 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.16 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  28.31 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.43 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  24.43 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30.18 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  21.88 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.37 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  21.88 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.22 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  27.14 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  26.72 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  25.7 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  28.41 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  28.65 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.89 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.72 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  27.78 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.89 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  23.2 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  27.72 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.89 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.89 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  27.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.89 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  26.6 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  25.79 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.46 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  26.37 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  27.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.47 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  34.12 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>