129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2357 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  100 
 
 
196 aa  398  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  65.13 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  62.5 
 
 
194 aa  239  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  61.46 
 
 
202 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  59.38 
 
 
194 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  60.31 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  56.84 
 
 
194 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  54.87 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  55.21 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  57.07 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  56.54 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  56.54 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  56.54 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  54.36 
 
 
195 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  56.02 
 
 
196 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  56.02 
 
 
196 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  54.4 
 
 
196 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  56.54 
 
 
196 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  56.54 
 
 
196 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  53.33 
 
 
195 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  58.55 
 
 
196 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  53.33 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  53.85 
 
 
210 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  51.01 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  53.93 
 
 
196 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  54.17 
 
 
196 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  50.52 
 
 
218 aa  205  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  52.04 
 
 
195 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  49.74 
 
 
196 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  53.4 
 
 
197 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  48.7 
 
 
197 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  49.74 
 
 
196 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  49.24 
 
 
201 aa  184  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  54.35 
 
 
199 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  49.22 
 
 
197 aa  177  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  44.22 
 
 
203 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  47.62 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  44.27 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  40.41 
 
 
201 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.16 
 
 
258 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  43.75 
 
 
208 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  41.58 
 
 
201 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  37.82 
 
 
208 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  41.67 
 
 
195 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.95 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  36.26 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  36.41 
 
 
221 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  35.08 
 
 
201 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  34.22 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.02 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.84 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.84 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  33.71 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.37 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.67 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.67 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  32.74 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.57 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.91 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  27.72 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  27.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  29.08 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.33 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.33 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.44 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  31.55 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.33 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.24 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  26.49 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  27.17 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  22.28 
 
 
207 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  29.95 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  21.2 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 
330 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  28.27 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  21.2 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  22.28 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.75 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  22.4 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  26.34 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  19.57 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  21.93 
 
 
329 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  24.83 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  23.33 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>