201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2096 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  61.86 
 
 
194 aa  249  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  53.72 
 
 
196 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  53.44 
 
 
202 aa  204  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  53.19 
 
 
196 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  53.19 
 
 
196 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  49.74 
 
 
195 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  49.22 
 
 
195 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  53.19 
 
 
196 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  52.66 
 
 
196 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  52.66 
 
 
196 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  52.66 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  52.91 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  53.72 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  52.13 
 
 
196 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  51.03 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  52.91 
 
 
196 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  48.7 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  46.88 
 
 
218 aa  195  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  53.68 
 
 
196 aa  195  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  48.7 
 
 
195 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  48.94 
 
 
196 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  53.44 
 
 
196 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  47.15 
 
 
196 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  46.89 
 
 
210 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  48.19 
 
 
196 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  50 
 
 
196 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  44.79 
 
 
195 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  48.19 
 
 
195 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  46.35 
 
 
195 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.59 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  46.63 
 
 
196 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  51.1 
 
 
199 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  45.45 
 
 
197 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  45.88 
 
 
197 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  46.19 
 
 
208 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  41.67 
 
 
201 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  49.4 
 
 
188 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  39.29 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  39.15 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.78 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  38.95 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.69 
 
 
213 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  39.69 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  38.97 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  36.46 
 
 
195 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  35.18 
 
 
221 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  31.41 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  31.84 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.11 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.84 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.78 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  31.32 
 
 
214 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.28 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.72 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.07 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.11 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.81 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.16 
 
 
200 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.88 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  27.23 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  26.6 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  31.21 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  31.21 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  23.59 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.81 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  22.64 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.14 
 
 
278 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  30.73 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.24 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.02 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.22 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.98 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.28 
 
 
330 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.07 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  24.16 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  30.11 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  30.57 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  30.57 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.5 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  24.43 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  26.59 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.18 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  30.57 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  24.85 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  29.94 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.99 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  23.12 
 
 
174 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>