200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4764 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  60.96 
 
 		 195 aa  244  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  59.07 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  60.43 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  57.14 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  57.97 
 
 		 210 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  60.42 
 
 		 202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.1 
 
 		 195 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  56.68 
 
 		 195 aa  228  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  56.48 
 
 		 194 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  56.15 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  56.15 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  56.15 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  56.15 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  55.61 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  55.61 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  54.01 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  53.06 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  55.21 
 
 		 194 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  57.22 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  56.41 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  54.55 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  54.55 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  53.81 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  52.28 
 
 		 197 aa  214  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  54.17 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.59 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  54.17 
 
 		 196 aa  207  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  52.08 
 
 		 218 aa  207  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  53.48 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  50.26 
 
 		 196 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  50.76 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  55.56 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  50.77 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  48.19 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  48.39 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  46.5 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  46.19 
 
 		 197 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  44.97 
 
 		 258 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  47.37 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  45.74 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  41.71 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  41.62 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  39.68 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  42.16 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  40.22 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.62 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  38.12 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  38.3 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  29.69 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.52 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  31.64 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  31.66 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  26.7 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  25.57 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  25.57 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  25.57 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  25.57 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  25.57 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  26.7 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  29.94 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  30.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  29.14 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.01 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  27.01 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  26.2 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.15 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  27.66 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  28.57 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  31.9 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  27.85 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  30.91 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.33 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  30.91 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  25.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.3 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  27.68 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  25.7 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>