161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1004 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  89.23 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  88.21 
 
 		 195 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  68.72 
 
 		 195 aa  298  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  68.21 
 
 		 195 aa  295  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  61.14 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.31 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  61.98 
 
 		 202 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  60.42 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  58.64 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  54.76 
 
 		 210 aa  237  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  57.81 
 
 		 194 aa  234  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  54.69 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  57.81 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  55.44 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  57.59 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  224  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  53.12 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0598996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  52.6 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  52.6 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  53.37 
 
 		 197 aa  220  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  52.91 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  52.08 
 
 		 196 aa  218  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  52.08 
 
 		 196 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  54.79 
 
 		 197 aa  214  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  51.01 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.58 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  54.08 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  52.33 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  52.33 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  48.45 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  48.7 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  53.33 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  46.6 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  46.32 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  158  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  43.85 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  43.16 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  49.08 
 
 		 188 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  39.69 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  39.29 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  43.75 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  37.81 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  38.14 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  36.73 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  34.78 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  31.05 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  31.14 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.13 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.88 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  30.91 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  29.76 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.29 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  25.98 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.26 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  33.33 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.41 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.38 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  24.59 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.23 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  26.67 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  25.99 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.15 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  25.7 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  24.06 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  23.08 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  28.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.65 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.42 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  22.91 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  29.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.4 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  25.45 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  26.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  24.29 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  26.54 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  21.13 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  27.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  26.54 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  27.12 
 
 		 253 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>