202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0358 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  80.51 
 
 
196 aa  317  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  73.3 
 
 
194 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  71.73 
 
 
202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  70.68 
 
 
195 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  63.27 
 
 
197 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  64.92 
 
 
194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  64.4 
 
 
194 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  61.78 
 
 
195 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  61.26 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  65.1 
 
 
195 aa  241  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  57.51 
 
 
196 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  57.51 
 
 
196 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  57.51 
 
 
196 aa  239  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  57.51 
 
 
196 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  56.99 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  56.99 
 
 
196 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  56.99 
 
 
196 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  57.51 
 
 
196 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  55.96 
 
 
196 aa  235  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  60.85 
 
 
194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  58.95 
 
 
196 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  56.41 
 
 
196 aa  227  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  58.67 
 
 
196 aa  225  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  60.31 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  53.4 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  56.77 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  56.41 
 
 
196 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  57.14 
 
 
197 aa  216  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  55.5 
 
 
195 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  55.22 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  62.3 
 
 
199 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  53.06 
 
 
197 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  53.23 
 
 
201 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  53.68 
 
 
194 aa  195  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  52.04 
 
 
197 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  53.53 
 
 
188 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  44.79 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  43.52 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  45.83 
 
 
206 aa  161  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  48.15 
 
 
208 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  46.35 
 
 
195 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  45.55 
 
 
201 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  43.01 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  43.22 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  41.97 
 
 
213 aa  147  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  39.9 
 
 
221 aa  135  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  39.79 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  36.26 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  38.42 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.81 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.94 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  32.02 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  34.3 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.67 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  33.53 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  27.6 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.93 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  28.57 
 
 
209 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  24.37 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  23.59 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.72 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.21 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  31.82 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.82 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.25 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  26.51 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  24.61 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  24.74 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.7 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  28 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  26.06 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  29.17 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  25.85 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  26.06 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  22.7 
 
 
350 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  28.06 
 
 
200 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.76 
 
 
183 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.71 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  31.78 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.87 
 
 
348 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  24.86 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  24.86 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  26.57 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>