161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0728 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  55.98 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  55.98 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  34.52 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  38.46 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  33.17 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  31.47 
 
 		 224 aa  97.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  34.95 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  33.5 
 
 		 226 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  33.87 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  31.63 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  37.5 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  29.94 
 
 		 223 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  31.25 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  30.21 
 
 		 223 aa  88.6  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  39.01 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  32.49 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  33.16 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  33.51 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  29.58 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  31.55 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  30.86 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.65 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.84 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.27 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.59 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  24.41 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.6 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  24.41 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  27.14 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  21.32 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.88 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  22.1 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  30.83 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  24.41 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  20.81 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  30.37 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  23.92 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.44 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  26.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  26.26 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.17 
 
 		 277 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  29.59 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  29.59 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.67 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.22 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.12 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  22.84 
 
 		 278 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  21.89 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.92 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  24.31 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  23.56 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.08 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.61 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  23.59 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.74 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.74 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  23.96 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.5 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  22.63 
 
 		 275 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.76 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.61 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  24.52 
 
 		 272 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  25.19 
 
 		 274 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.15 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  23.44 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  19.29 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.38 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.01 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.19 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.55 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.28 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  25.17 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  23.12 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  23.7 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  39.68 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  27.59 
 
 		 363 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  24.03 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.02 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  22.11 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  22.48 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  38.78 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  26.23 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  25.81 
 
 		 348 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  39.29 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  23.68 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.2 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.72 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  22.98 
 
 		 279 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  22.51 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  22.77 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  26.15 
 
 		 321 aa  45.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  23.48 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>