265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2969 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  77.68 
 
 		 223 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  76.23 
 
 		 226 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  75.23 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  73.21 
 
 		 223 aa  353  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  73.21 
 
 		 224 aa  346  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  65.91 
 
 		 224 aa  298  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  65.05 
 
 		 205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  59.17 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  58.26 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  60.42 
 
 		 224 aa  234  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  55.78 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  51.31 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  46.98 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  46.82 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  50.26 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  46.12 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  35.06 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  35.06 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  37.5 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.29 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.81 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.77 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  30 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  54.17 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  34.43 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.53 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.68 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.17 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  57.14 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.41 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.94 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  51.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  51.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  51.11 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.29 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  47.06 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  43.4 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.14 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  44.9 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.11 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.26 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.01 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.94 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  41.18 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.26 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.92 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.78 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.26 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  43.64 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  38.18 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  25.68 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.55 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  53.33 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.71 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.71 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  29.87 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  43.14 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  44.44 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.64 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  29.57 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  23.81 
 
 		 173 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  41.18 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  25.51 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  29.55 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  46 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  24.58 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  37.5 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.14 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.63 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.95 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.21 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  41.07 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  52.38 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  35.63 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  45.16 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  44.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.18 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  44 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.14 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.9 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.93 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.84 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  40.74 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  39.29 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  48.78 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  51.11 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.43 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  37.74 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 265 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  44.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  48 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>