More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  51.35 
 
 
228 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  49.07 
 
 
236 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  51.35 
 
 
224 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  48.87 
 
 
231 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  47.79 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  50.23 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  47.06 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  46.36 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  46.15 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  46.88 
 
 
257 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  49.32 
 
 
233 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  49.09 
 
 
242 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  50 
 
 
229 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  49.09 
 
 
242 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  45.25 
 
 
242 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  50.23 
 
 
239 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  47.51 
 
 
233 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  48.64 
 
 
242 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  48.64 
 
 
242 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  46.12 
 
 
247 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  49.77 
 
 
228 aa  205  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  45.09 
 
 
223 aa  205  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  46.4 
 
 
246 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  44.8 
 
 
224 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  45.05 
 
 
237 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  43.5 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  44.64 
 
 
236 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  42.6 
 
 
254 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  41.85 
 
 
249 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  47.25 
 
 
239 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  42.92 
 
 
231 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  46.46 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  42.6 
 
 
223 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  42.66 
 
 
223 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  42.73 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  41.78 
 
 
240 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  40.37 
 
 
226 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  42.04 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  40.54 
 
 
229 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  41.96 
 
 
220 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  41.55 
 
 
228 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  42.04 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  41.1 
 
 
241 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  40.36 
 
 
219 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  39.35 
 
 
225 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  41.26 
 
 
223 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  39.91 
 
 
219 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  38.74 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  45.19 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  44.23 
 
 
232 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  37.84 
 
 
221 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  39.27 
 
 
232 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  38.22 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  39.29 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  39.01 
 
 
221 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  39.73 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  38.79 
 
 
225 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  37.67 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  39.19 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  35.87 
 
 
235 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  35.43 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  38.12 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  35.43 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.33 
 
 
224 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  36.64 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  35.71 
 
 
231 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  39.55 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.98 
 
 
222 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  35.78 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  34.07 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  36.21 
 
 
225 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  35.02 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  31.22 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  34.91 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  34.23 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.4 
 
 
220 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  34.74 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.18 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  31.8 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  32.74 
 
 
237 aa  111  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  34.93 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  30.56 
 
 
228 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  31.28 
 
 
229 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  34.82 
 
 
270 aa  98.6  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.92 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25.45 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.04 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.69 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.31 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  28.98 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  32.35 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  29.65 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  48.08 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.19 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.55 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.19 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.14 
 
 
584 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  27.36 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>