More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1291 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  45.7 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  38.34 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  32.63 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  33.52 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  36.08 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  31.86 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  32.42 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  32.42 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  35.67 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  32.42 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  32.64 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  38.6 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  32.42 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  34.09 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  32.62 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  33.51 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  34.9 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  31.55 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  32.09 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  31.55 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  31.55 
 
 		 182 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  33.86 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  31.18 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.41 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  32.52 
 
 		 235 aa  92  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  28.02 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  28.02 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.41 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.41 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.78 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  32.82 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  33.52 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  31.91 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  28.88 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.58 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  29.82 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  31.28 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.32 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  33.15 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  28.34 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  31.02 
 
 		 182 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  31.03 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  35.67 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  30.46 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  32.12 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  27.13 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  31.03 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  34.68 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  34.68 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  31.4 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  35.33 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.77 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  33.33 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  29.79 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  29.94 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  30.64 
 
 		 221 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  34.52 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  30.41 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.18 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  32.95 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  32.2 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  31.79 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  32.95 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  30.41 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  29.14 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  34.13 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  26.11 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  29.15 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30.5 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  30.41 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  27.72 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  31.93 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  28.27 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>