More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1262 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  87.17 
 
 
241 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  83.11 
 
 
226 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  83.11 
 
 
226 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  82.67 
 
 
226 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  51.46 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  39.07 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  34.63 
 
 
223 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  32.24 
 
 
234 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  32.3 
 
 
239 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  30.37 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  29.68 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  30.66 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.58 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.87 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.73 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  31.63 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  31.48 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.5 
 
 
165 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.24 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.76 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.37 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.23 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.05 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  30.14 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.74 
 
 
167 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  28.3 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.7 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  29.44 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  29.44 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  29.11 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.92 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  30.1 
 
 
546 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  29.44 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.57 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.07 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.9 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.67 
 
 
584 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.28 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  25.35 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  28.84 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.11 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.56 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.36 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.38 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  28.44 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.5 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.63 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.94 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.13 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  27.1 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  28.99 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.04 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.75 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.47 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  28.51 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  31.16 
 
 
173 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.62 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.13 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.76 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  28.37 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.37 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.23 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.76 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  29.7 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.36 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.6 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  29 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.6 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.25 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.58 
 
 
194 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.77 
 
 
247 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.02 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.91 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.33 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.84 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.06 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  30.41 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.4 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
411 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
351 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.12 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  23.33 
 
 
170 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3155  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182044  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.69 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  29.55 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  29.91 
 
 
394 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  29.44 
 
 
368 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.06 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  26.5 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.24 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.4 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2608  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.97 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.469084  normal  0.0132416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  50.98 
 
 
222 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  22.12 
 
 
215 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>