225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2581 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  68.95 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  67.12 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  60.71 
 
 		 224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  42.79 
 
 		 546 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  37.5 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  36.99 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  31.65 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  34.55 
 
 		 280 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  33.06 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  32.44 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.5 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.21 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.44 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  30.56 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.93 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  28.45 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  29.41 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  28.21 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  28.57 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.53 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  25.97 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  25.97 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  25.76 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.06 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.05 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.94 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.46 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.08 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.18 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  30.61 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.05 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.06 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.3 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.23 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  28.23 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.98 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  27.48 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  28.32 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.26 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  26.79 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  26.79 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  27.34 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.59 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  23.47 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  22.86 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  27.23 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  25.57 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  27.5 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.08 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.64 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.11 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.72 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.4 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  25.23 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  25.23 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  25.23 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  22.41 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.52 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  42.37 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  27.85 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.11 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  30.89 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  34.78 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  24.88 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.32 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.82 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.84 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.46 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  28.44 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  25.84 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.18 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.35 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.73 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  34.18 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 167 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.51 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  30.64 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.87 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.96 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.93 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  31.09 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.5 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.42 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  26.55 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  41.18 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.5 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  41.18 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  37.97 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.08 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.8 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.32 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.24 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.2 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.82 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  25.27 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  22.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  22.48 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  23.25 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>