More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0926 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  54.26 
 
 
223 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  52.02 
 
 
223 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  49.55 
 
 
221 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  49.32 
 
 
225 aa  225  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  49.33 
 
 
226 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  45.66 
 
 
225 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  47.53 
 
 
219 aa  214  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  47.53 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  48.65 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  45.74 
 
 
235 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  47.75 
 
 
229 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.05 
 
 
233 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  47.73 
 
 
242 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  48.18 
 
 
239 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  45.45 
 
 
247 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  45.41 
 
 
228 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  46.64 
 
 
229 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  44.14 
 
 
235 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  46.26 
 
 
236 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  47.73 
 
 
242 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  47.27 
 
 
242 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  47.27 
 
 
242 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  46.36 
 
 
246 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  45.25 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  41.89 
 
 
221 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  44.34 
 
 
235 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  44.95 
 
 
239 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  44.3 
 
 
258 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  42.73 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  43.18 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  43.18 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  41.82 
 
 
221 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  42.79 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  43.3 
 
 
220 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  44.64 
 
 
257 aa  187  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.49 
 
 
221 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  42.27 
 
 
254 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  42.99 
 
 
233 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  42.73 
 
 
222 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  41.94 
 
 
242 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.6 
 
 
224 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  39.91 
 
 
223 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  44.34 
 
 
249 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  41.94 
 
 
224 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  41.82 
 
 
254 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  41.7 
 
 
236 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  39.63 
 
 
240 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  40.37 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  40.54 
 
 
228 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  43.56 
 
 
245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  39.38 
 
 
231 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  39.64 
 
 
226 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  40.64 
 
 
228 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  36.82 
 
 
237 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  38.03 
 
 
241 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.82 
 
 
220 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  33.94 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  35 
 
 
237 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  37.21 
 
 
232 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  36.74 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  35.84 
 
 
225 aa  134  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.79 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  33.79 
 
 
232 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  33.03 
 
 
244 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  33.95 
 
 
238 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  33.64 
 
 
231 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  31.42 
 
 
224 aa  121  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  33.33 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.64 
 
 
228 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  30.7 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.46 
 
 
231 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  32.14 
 
 
218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.3 
 
 
270 aa  108  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  31.98 
 
 
225 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  29.91 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  31.3 
 
 
223 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  29.07 
 
 
235 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  30.22 
 
 
241 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.82 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28 
 
 
225 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  31.6 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  27.71 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  27.95 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  27.31 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.86 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  27.51 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.19 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.88 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.97 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.44 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.76 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.71 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  26.27 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.82 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  26.67 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.36 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.33 
 
 
334 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  22.41 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  26.13 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>