More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2480 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 546 aa  1077    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  43.54 
 
 		 337 aa  287  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  50.16 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  50.16 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  50.16 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  43.45 
 
 		 349 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  48.02 
 
 		 230 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  47.3 
 
 		 341 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  45.65 
 
 		 328 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  43.65 
 
 		 351 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  40.8 
 
 		 345 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  41.42 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  39.56 
 
 		 320 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  34.36 
 
 		 350 aa  187  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  39.36 
 
 		 294 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  47.29 
 
 		 218 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  41.36 
 
 		 224 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  41.55 
 
 		 225 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  41.67 
 
 		 219 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  42.79 
 
 		 236 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  33.02 
 
 		 221 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  31.09 
 
 		 234 aa  92  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  34.42 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  29.86 
 
 		 239 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  28.57 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.95 
 
 		 186 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  31 
 
 		 226 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  31 
 
 		 226 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  31 
 
 		 226 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  31.58 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  32.32 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  31.03 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  30.81 
 
 		 214 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.09 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  31.25 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.43 
 
 		 170 aa  73.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.74 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.38 
 
 		 190 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  29.9 
 
 		 206 aa  72.8  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.5 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  28.64 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  27.18 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  27.9 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  30.58 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.78 
 
 		 186 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  30.58 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  30.58 
 
 		 213 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  24.65 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.56 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  27.53 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.84 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.69 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.49 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  27.53 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26 
 
 		 176 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.64 
 
 		 339 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.72 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.27 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  28.5 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.77 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.43 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  27.27 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.91 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  27.21 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  27.21 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.74 
 
 		 183 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.12 
 
 		 196 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  24.29 
 
 		 338 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  27.17 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 188 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  27.82 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  26.84 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  24.57 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  28.04 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  28.15 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  26.13 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  26.43 
 
 		 357 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 411 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  22.82 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  28.36 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  24.29 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.5 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  25.63 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.04 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.31 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  27.75 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.5 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.14 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.79 
 
 		 171 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  27.55 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.27 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  29.06 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.57 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.38 
 
 		 165 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  22.66 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>