149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2149 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  81.28 
 
 
219 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  68.95 
 
 
236 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  60.27 
 
 
224 aa  278  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  41.55 
 
 
546 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0797  nitroreductase  34.98 
 
 
230 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  34.1 
 
 
218 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.55 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  32.54 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  30.23 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  31.56 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13404  oxidoreductase  29.78 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.15844e-25  normal  0.575826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  29.86 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.83 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  28.89 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  28.89 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  28.44 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.5 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  29.6 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  26.55 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  30.91 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.69 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.82 
 
 
177 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.56 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  27.15 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  25.81 
 
 
225 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4892  nitroreductase  29.15 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.967064  normal  0.0361814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.05 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.3 
 
 
176 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.92 
 
 
186 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  21.7 
 
 
180 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4099  nitroreductase  28.5 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.23 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  26.27 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  30.33 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.8 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  25.46 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  25.67 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  27.51 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.24 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.65 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1184  nitroreductase  26.72 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.77 
 
 
170 aa  56.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1201  nitroreductase  26.72 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223399  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1211  nitroreductase  26.72 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.120576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  29.17 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  28.43 
 
 
272 aa  55.1  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.77 
 
 
186 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  23.08 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  22.97 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  24.26 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  22.54 
 
 
278 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  25.81 
 
 
257 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.42 
 
 
167 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  23.36 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  21.86 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  26.73 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  24.55 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  28.16 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  23.92 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.48 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  32.35 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  40.58 
 
 
221 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  25.37 
 
 
196 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0337  nitroreductase  28.93 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  22.05 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  26.5 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.89 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  23.59 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.94 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  25.81 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  21.54 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  24.64 
 
 
171 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.26 
 
 
166 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  24.87 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  24.76 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  35.59 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.02 
 
 
180 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2211  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.41 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.249777  normal  0.157352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1352  nitroreductase  29.45 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  26.7 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  27.72 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.43 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.98 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.5 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.5 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  25.35 
 
 
329 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  26.13 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  25.26 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25.37 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  41.67 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.04 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  28.29 
 
 
169 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  34.67 
 
 
284 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  23.08 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.87 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  43.75 
 
 
245 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>