More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3427 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  46.86 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.43 
 
 		 165 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.04 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.5 
 
 		 177 aa  89  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.47 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.57 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.86 
 
 		 167 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.88 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.37 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.38 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.09 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.64 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  29.47 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.52 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.62 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.73 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.21 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  27.32 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  27.32 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  28.57 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.35 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.21 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5999  nitroreductase  27.67 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.21 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.18 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26.21 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.73 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.29 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.53 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  29.58 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  26.15 
 
 		 450 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.96 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.41 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  28.06 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.14 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.44 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  36.11 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.37 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.25 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.37 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  22.49 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  27.01 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.14 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.38 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.17 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  25.53 
 
 		 461 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  25.87 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  25.12 
 
 		 431 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  27.05 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.76 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  25.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  25.94 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.45 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.5 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.11 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  23.63 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.17 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.4 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  27.23 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.36 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.36 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  35.64 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.7 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  23.96 
 
 		 458 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  24.73 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  25.95 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  22.95 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.66 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  27.05 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25 
 
 		 180 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.88 
 
 		 584 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  26.56 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.75 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.8 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.6 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  25.13 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  25.47 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.89 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.52 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  32.69 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  24.4 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.68 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  34.29 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  26.67 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.89 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  34.43 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  22.51 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  26.46 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.2 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  32.73 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.09 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.27 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>