256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3303 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  100 
 
 		 458 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  68.4 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  69.61 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  69.61 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.82 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  69.53 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  62.05 
 
 		 450 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  68.3 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.22 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  63.89 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  58.93 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47.43 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.47 
 
 		 526 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  49.77 
 
 		 431 aa  346  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.87 
 
 		 423 aa  342  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  49.41 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.23 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.53 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.94 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.75 
 
 		 363 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.68 
 
 		 362 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  55.37 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.3 
 
 		 289 aa  186  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.33 
 
 		 321 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 283 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 271 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.37 
 
 		 251 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  48.19 
 
 		 251 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  49.78 
 
 		 264 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 253 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  44.49 
 
 		 251 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  46.57 
 
 		 232 aa  150  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.26 
 
 		 241 aa  147  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.86 
 
 		 257 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 257 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  49.4 
 
 		 251 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.9 
 
 		 244 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  48.82 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  45.05 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  39.92 
 
 		 252 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  41.2 
 
 		 260 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.58 
 
 		 375 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.65 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.51 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  37.77 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.31 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.2 
 
 		 248 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 254 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.2 
 
 		 248 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.78 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.84 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.97 
 
 		 250 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  39.06 
 
 		 200 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.38 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  34.36 
 
 		 209 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.51 
 
 		 248 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 291 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  35.43 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.61 
 
 		 251 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  34.25 
 
 		 257 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.45 
 
 		 245 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.75 
 
 		 249 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.26 
 
 		 255 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.89 
 
 		 251 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  33.68 
 
 		 217 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.21 
 
 		 256 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.3 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.05 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  33.79 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.1 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.67 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.34 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.81 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.12 
 
 		 170 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.82 
 
 		 190 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  26.18 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.1 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.73 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  34.96 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.38 
 
 		 188 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  23.81 
 
 		 212 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  35.95 
 
 		 243 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.49 
 
 		 190 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  29.06 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.97 
 
 		 176 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.16 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.84 
 
 		 174 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  23.96 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  26.26 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.72 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.05 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.93 
 
 		 236 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  30.89 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.84 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>