More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0748 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  827    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  74.7 
 
 
439 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  74.54 
 
 
431 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  74.29 
 
 
423 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  69.3 
 
 
431 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60.47 
 
 
442 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60 
 
 
526 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.52 
 
 
463 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  61.02 
 
 
430 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  52.19 
 
 
450 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.76 
 
 
448 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.81 
 
 
461 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  49.88 
 
 
446 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  49.89 
 
 
425 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50 
 
 
446 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.91 
 
 
471 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.91 
 
 
455 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.91 
 
 
455 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  49.3 
 
 
458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.45 
 
 
448 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  64.35 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  56.07 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.6 
 
 
363 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  52.36 
 
 
362 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  52.1 
 
 
271 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  62.32 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
253 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  50.4 
 
 
251 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  53.08 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  48.61 
 
 
251 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.83 
 
 
251 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  51.85 
 
 
273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  48.11 
 
 
351 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  46.38 
 
 
232 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  49.4 
 
 
244 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.87 
 
 
241 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.54 
 
 
257 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  46.28 
 
 
251 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  42.13 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  39.15 
 
 
257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  42.13 
 
 
256 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.95 
 
 
244 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.16 
 
 
256 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  50 
 
 
375 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  40.87 
 
 
252 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
260 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.16 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.24 
 
 
248 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.41 
 
 
251 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.78 
 
 
248 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 
254 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.09 
 
 
256 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.4 
 
 
250 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  37.87 
 
 
257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.22 
 
 
251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.94 
 
 
245 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.45 
 
 
250 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.84 
 
 
249 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.18 
 
 
251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.45 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  36.57 
 
 
348 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.39 
 
 
256 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  32.73 
 
 
388 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.11 
 
 
269 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  35.94 
 
 
200 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  32.43 
 
 
350 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  32.99 
 
 
209 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.96 
 
 
268 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  35.42 
 
 
217 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  31.25 
 
 
304 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  35.21 
 
 
258 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  33.68 
 
 
209 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.64 
 
 
227 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  27.06 
 
 
234 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.97 
 
 
257 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  31.77 
 
 
259 aa  89.7  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  26.61 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.94 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.46 
 
 
221 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.14 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  34.07 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.66 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  26.05 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.12 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.63 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.81 
 
 
167 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  33.71 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  39.69 
 
 
242 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  33.64 
 
 
243 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  33.71 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.02 
 
 
167 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.71 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.28 
 
 
247 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  33.71 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  33.71 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  33.71 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.28 
 
 
247 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>