More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5869 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 526 aa  1023    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  77.13 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  59.68 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  56.88 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  59.76 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  56.5 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  60.23 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  55.48 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.66 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.25 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.91 
 
 		 448 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.69 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.02 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  58.1 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.02 
 
 		 471 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  51.12 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.56 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.56 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.95 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.64 
 
 		 425 aa  316  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  55.56 
 
 		 363 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  54.08 
 
 		 362 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  56.15 
 
 		 387 aa  203  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.78 
 
 		 289 aa  200  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.01 
 
 		 251 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.9 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 271 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.25 
 
 		 251 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  42.91 
 
 		 253 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 283 aa  176  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  51 
 
 		 264 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  50.2 
 
 		 251 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  44.09 
 
 		 251 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.7 
 
 		 241 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  43.98 
 
 		 232 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  40.08 
 
 		 257 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  49.59 
 
 		 273 aa  146  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  42.69 
 
 		 244 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  41.25 
 
 		 259 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.16 
 
 		 257 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.89 
 
 		 248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 260 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.36 
 
 		 351 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.43 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 256 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.06 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  39.15 
 
 		 252 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.96 
 
 		 248 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.4 
 
 		 250 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.94 
 
 		 256 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.57 
 
 		 250 aa  114  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.03 
 
 		 375 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.6 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 254 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.32 
 
 		 245 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.51 
 
 		 255 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.29 
 
 		 244 aa  107  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  37.79 
 
 		 209 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  40 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.46 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.27 
 
 		 350 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.5 
 
 		 249 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.91 
 
 		 227 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  37.78 
 
 		 217 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.71 
 
 		 251 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  39.43 
 
 		 209 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  39.68 
 
 		 200 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  38.95 
 
 		 291 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.69 
 
 		 256 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.53 
 
 		 268 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  33.95 
 
 		 257 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  33.03 
 
 		 258 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  31.75 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  38.7 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  27.73 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  27.62 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.69 
 
 		 257 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  40.27 
 
 		 242 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  25.94 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  27.93 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.92 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.88 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  31.89 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  34.39 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  21.88 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.39 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  34.39 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.74 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 247 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.57 
 
 		 167 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25 
 
 		 180 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.53 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>