More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2518 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 423 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  74.47 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  74.71 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  74.29 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  68.16 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60.39 
 
 		 526 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  59.71 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.68 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  62.8 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.44 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.35 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.9 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  52.9 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.58 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  51.87 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.4 
 
 		 471 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.29 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.4 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.4 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.33 
 
 		 448 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  58.68 
 
 		 321 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  61.8 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  54.32 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  54.58 
 
 		 271 aa  222  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  56.12 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  58.68 
 
 		 264 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  58.02 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  53.1 
 
 		 283 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  49.6 
 
 		 251 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.6 
 
 		 251 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  53.66 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  48.81 
 
 		 253 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  49.36 
 
 		 232 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  46.22 
 
 		 251 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.88 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.74 
 
 		 241 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  48.8 
 
 		 244 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 257 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.02 
 
 		 257 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 256 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.45 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.46 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.48 
 
 		 251 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  44.58 
 
 		 251 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.61 
 
 		 250 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.07 
 
 		 245 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  49.37 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 259 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.64 
 
 		 249 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.98 
 
 		 255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.3 
 
 		 251 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  42.06 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.33 
 
 		 248 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.33 
 
 		 248 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.96 
 
 		 248 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.22 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.98 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  37.1 
 
 		 257 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.53 
 
 		 250 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 291 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  35.42 
 
 		 209 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.71 
 
 		 256 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  38.76 
 
 		 348 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.6 
 
 		 268 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.18 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  37.3 
 
 		 200 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  36.28 
 
 		 388 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.5 
 
 		 227 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  36.15 
 
 		 258 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  35.52 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  33.85 
 
 		 217 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 267 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.45 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  30.43 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.49 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.89 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25.12 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.14 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.35 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  34.06 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.18 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.27 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.79 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.87 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.26 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.67 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.86 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2617  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.86 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.67 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.58 
 
 		 169 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  29.48 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.3 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.43 
 
 		 177 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.3 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>