76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2468 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  93.8 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  93.42 
 
 		 243 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  46.26 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  40.8 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  34.78 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.94 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.74 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.62 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.48 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.7 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  29.06 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.54 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.54 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.47 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.33 
 
 		 442 aa  99  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  27.8 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.58 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.25 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.73 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  37.7 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.65 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 431 aa  92  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.61 
 
 		 526 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.83 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.53 
 
 		 321 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.22 
 
 		 425 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.76 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  31 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  36.36 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  28 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.16 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  28.69 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  27.92 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.9 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.06 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.62 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.91 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.18 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.25 
 
 		 430 aa  72.4  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.86 
 
 		 362 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.44 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.84 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  32.74 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.76 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.43 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  25.22 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.62 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.89 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.14 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.09 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.41 
 
 		 455 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.41 
 
 		 455 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.19 
 
 		 471 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  35 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  26.29 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>