172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1340 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 455 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 455 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  75.51 
 
 		 446 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  95.12 
 
 		 471 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  75.51 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  77.83 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  69.61 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  66.82 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  67.19 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  69.16 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60.96 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  50.23 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  52.59 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.05 
 
 		 526 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.4 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.36 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  51.66 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  51.49 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.01 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.37 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.75 
 
 		 363 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  53.16 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  54.94 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.84 
 
 		 289 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.13 
 
 		 321 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 271 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  50.37 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  45.93 
 
 		 251 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  41.2 
 
 		 253 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.68 
 
 		 251 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 264 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 251 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  44.53 
 
 		 252 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  41.57 
 
 		 257 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.27 
 
 		 241 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47.74 
 
 		 244 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 232 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  47.15 
 
 		 251 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  47.24 
 
 		 273 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 259 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  39.92 
 
 		 256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.49 
 
 		 351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.77 
 
 		 256 aa  127  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 256 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.24 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.56 
 
 		 248 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 254 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.54 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.02 
 
 		 250 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.68 
 
 		 248 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.87 
 
 		 248 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.62 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.53 
 
 		 250 aa  114  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.76 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.13 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.84 
 
 		 249 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  34.27 
 
 		 217 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 291 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.98 
 
 		 244 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.74 
 
 		 255 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.77 
 
 		 227 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.73 
 
 		 268 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  32.64 
 
 		 258 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  32.78 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  33.33 
 
 		 209 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  28.25 
 
 		 234 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.97 
 
 		 350 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  34.07 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  29.8 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  30.38 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  34.68 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.87 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  28.35 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  34.65 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  27.41 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  27.67 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  34.25 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.21 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.82 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.46 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.64 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  24.86 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.77 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.23 
 
 		 233 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  33.78 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  34.65 
 
 		 243 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.65 
 
 		 186 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.91 
 
 		 177 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.03 
 
 		 176 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.32 
 
 		 202 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.66 
 
 		 184 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.02 
 
 		 186 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.42 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>