85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1335 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  55.87 
 
 
268 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  49.8 
 
 
256 aa  252  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  52 
 
 
267 aa  248  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  50.41 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.8 
 
 
388 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  45.33 
 
 
269 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.78 
 
 
257 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  39.9 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  43.16 
 
 
253 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.22 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  36.59 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.79 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.72 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.79 
 
 
248 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.25 
 
 
248 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.6 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.86 
 
 
244 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.95 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.75 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.31 
 
 
251 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  41.12 
 
 
227 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.12 
 
 
256 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  38.34 
 
 
217 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.51 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  41.09 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.21 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
431 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.42 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.8 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  40.93 
 
 
244 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 
423 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.91 
 
 
425 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  40.97 
 
 
234 aa  106  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
259 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
427 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.12 
 
 
431 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.18 
 
 
257 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  35.23 
 
 
245 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.8 
 
 
251 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.14 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.05 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.09 
 
 
362 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.4 
 
 
363 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  39.31 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.94 
 
 
463 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
271 aa  95.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
387 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.95 
 
 
526 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  27.71 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.07 
 
 
430 aa  89.4  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  39 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.93 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.79 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.82 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  29.08 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  31.47 
 
 
450 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  29.69 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.8 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.88 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.25 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.37 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.09 
 
 
351 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.62 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.32 
 
 
471 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.62 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.19 
 
 
461 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.5 
 
 
448 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0771  hypothetical protein  25.4 
 
 
296 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  25.15 
 
 
298 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1219  hypothetical protein  24.66 
 
 
516 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.758557  hitchhiker  0.00139913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0936  hypothetical protein  25.15 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.112147  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  23.94 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>