20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0936 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0936  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.112147  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  95.97 
 
 
298 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  93.96 
 
 
298 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  81.12 
 
 
289 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0771  hypothetical protein  67.71 
 
 
296 aa  424  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  27.07 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.09 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  25.91 
 
 
388 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  25.15 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  27.34 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.92 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  24.5 
 
 
252 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.82 
 
 
450 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  22.75 
 
 
526 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  24.4 
 
 
442 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
431 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 
430 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  21.74 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>