More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0741 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 442 aa  851    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  77.15 
 
 		 526 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  61.76 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  59.91 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  60.93 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  59.04 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  54.5 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.96 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  56.84 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60.41 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  57.4 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.47 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.22 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.36 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.56 
 
 		 471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.92 
 
 		 448 aa  358  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.99 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.99 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  50.81 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.67 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  56.89 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  55.83 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  58.58 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  55.95 
 
 		 289 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.15 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  48.09 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.77 
 
 		 251 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  50.2 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  45.2 
 
 		 253 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 264 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 232 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  49.6 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 251 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 257 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  48.64 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.84 
 
 		 241 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  53.92 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.82 
 
 		 244 aa  146  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.49 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  40.7 
 
 		 259 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 260 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  42.19 
 
 		 252 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  39.18 
 
 		 256 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.16 
 
 		 248 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.88 
 
 		 256 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.16 
 
 		 248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.7 
 
 		 250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.7 
 
 		 248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.57 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.56 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.78 
 
 		 250 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.8 
 
 		 245 aa  122  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.48 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.67 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  36.65 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  39.13 
 
 		 209 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.3 
 
 		 244 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  40.32 
 
 		 209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 254 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.13 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  40.23 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  40.1 
 
 		 200 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.97 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  41.07 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.16 
 
 		 227 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  34.64 
 
 		 217 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.38 
 
 		 256 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  40.35 
 
 		 243 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.62 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.72 
 
 		 269 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  39.04 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  29.7 
 
 		 234 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  30.8 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  25.38 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  37.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  37.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  37.64 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  37.64 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  28.71 
 
 		 243 aa  75.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  37.64 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.16 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  27.57 
 
 		 213 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.98 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  31.79 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1657  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.96 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  34.83 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.96 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.39 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  29.57 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.87 
 
 		 216 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.39 
 
 		 247 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.96 
 
 		 249 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>