More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1962 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  100 
 
 
430 aa  827    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  62.5 
 
 
431 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  62.8 
 
 
423 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  57.7 
 
 
431 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  57.58 
 
 
439 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  61.74 
 
 
427 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  60.81 
 
 
442 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  58.15 
 
 
526 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.04 
 
 
463 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.38 
 
 
446 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  52.04 
 
 
450 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  57.54 
 
 
461 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  52.55 
 
 
458 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.46 
 
 
448 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.38 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.01 
 
 
455 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  55.01 
 
 
455 aa  353  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.55 
 
 
471 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.93 
 
 
448 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.65 
 
 
425 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  55.02 
 
 
283 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  58.37 
 
 
289 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.08 
 
 
363 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.9 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  51.65 
 
 
271 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.22 
 
 
321 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.8 
 
 
251 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  60.47 
 
 
264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.2 
 
 
251 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  57.33 
 
 
387 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  47.79 
 
 
253 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  50 
 
 
232 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  47.97 
 
 
251 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  59.3 
 
 
273 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  50 
 
 
351 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.79 
 
 
241 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  46.56 
 
 
252 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47.97 
 
 
244 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  42.19 
 
 
257 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.55 
 
 
248 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.71 
 
 
248 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.4 
 
 
251 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  50.64 
 
 
375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  41.02 
 
 
257 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.29 
 
 
248 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
260 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.63 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.13 
 
 
250 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.13 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.99 
 
 
244 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.09 
 
 
256 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.43 
 
 
256 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.24 
 
 
251 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.08 
 
 
249 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
254 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 
255 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  35.79 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.08 
 
 
251 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  32.42 
 
 
388 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  36.98 
 
 
200 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  35.21 
 
 
258 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.91 
 
 
256 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  33.07 
 
 
257 aa  107  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.5 
 
 
268 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.41 
 
 
227 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  34.9 
 
 
217 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.89 
 
 
257 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
291 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  28.57 
 
 
234 aa  103  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  36.36 
 
 
209 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  37.1 
 
 
267 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  35.8 
 
 
348 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.71 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.38 
 
 
209 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  30.31 
 
 
304 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  30.21 
 
 
243 aa  86.7  9e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  37.3 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  37.7 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.15 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.71 
 
 
180 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.36 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.84 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  29.65 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  29.59 
 
 
245 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.69 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.97 
 
 
163 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  24.52 
 
 
213 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  35.56 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.13 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.1 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.15 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.69 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.26 
 
 
247 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.74 
 
 
190 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.02 
 
 
173 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  34.44 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>