More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1379 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  100 
 
 
439 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  74.7 
 
 
427 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  67.52 
 
 
431 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  68.05 
 
 
431 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  68.16 
 
 
423 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.34 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.47 
 
 
526 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  51.88 
 
 
450 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  53.69 
 
 
448 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.33 
 
 
446 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  54.72 
 
 
442 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  57.58 
 
 
430 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.91 
 
 
463 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.9 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.23 
 
 
471 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.23 
 
 
455 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  50.23 
 
 
455 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  47.43 
 
 
458 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.91 
 
 
425 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  49.32 
 
 
448 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  59.92 
 
 
363 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  57.56 
 
 
362 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  52.92 
 
 
271 aa  220  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  51.79 
 
 
321 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  58.3 
 
 
289 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  53.91 
 
 
387 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  47.56 
 
 
251 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  58.54 
 
 
264 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  50.57 
 
 
283 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
253 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.6 
 
 
251 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.97 
 
 
251 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  48.07 
 
 
232 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.59 
 
 
241 aa  170  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  46.59 
 
 
244 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
273 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
259 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  43.37 
 
 
251 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  45.75 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.65 
 
 
257 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
257 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  40.31 
 
 
256 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  39.13 
 
 
252 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
254 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.27 
 
 
244 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.42 
 
 
251 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.81 
 
 
251 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
260 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.5 
 
 
248 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.52 
 
 
249 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.2 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  41.55 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.6 
 
 
250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.61 
 
 
248 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.74 
 
 
248 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.49 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.04 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.9 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  33.33 
 
 
209 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.78 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.06 
 
 
245 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  32.12 
 
 
350 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  37.81 
 
 
217 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  35.96 
 
 
348 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.21 
 
 
256 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.22 
 
 
209 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  32.52 
 
 
291 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  33.85 
 
 
200 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.34 
 
 
227 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  31.42 
 
 
269 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  32.93 
 
 
257 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.95 
 
 
268 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.07 
 
 
388 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  93.2  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  32.87 
 
 
258 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
267 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.38 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  26.61 
 
 
304 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  29.95 
 
 
243 aa  75.9  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.74 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.8 
 
 
221 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.52 
 
 
163 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4995  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.81 
 
 
219 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104109  hitchhiker  0.00247191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.08 
 
 
176 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.35 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  32 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  32 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  29.21 
 
 
245 aa  69.7  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  32 
 
 
219 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.02 
 
 
174 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32 
 
 
219 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  32 
 
 
351 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  23.22 
 
 
213 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  39.86 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  32 
 
 
219 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.65 
 
 
167 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.73 
 
 
170 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  29.3 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.32 
 
 
231 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>