79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1194 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  100 
 
 
249 aa  503  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  67.62 
 
 
245 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  66.39 
 
 
254 aa  342  5e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  69.78 
 
 
227 aa  340  9e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  63.26 
 
 
217 aa  293  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.26 
 
 
244 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  46.88 
 
 
260 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.5 
 
 
251 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.06 
 
 
255 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  45.97 
 
 
256 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.35 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.4 
 
 
251 aa  185  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.42 
 
 
250 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.19 
 
 
248 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.87 
 
 
250 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.64 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.59 
 
 
248 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  39.56 
 
 
252 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.63 
 
 
241 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.6 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.55 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.89 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  39.51 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.47 
 
 
268 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  40.44 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.21 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  38.84 
 
 
431 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
431 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  35.14 
 
 
258 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.43 
 
 
321 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  39.09 
 
 
256 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  35.23 
 
 
388 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.54 
 
 
423 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
259 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.47 
 
 
251 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.37 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.09 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.91 
 
 
363 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
257 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.65 
 
 
362 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
291 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.74 
 
 
269 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  27.89 
 
 
304 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
427 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.52 
 
 
439 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 
425 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.89 
 
 
463 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  36.44 
 
 
251 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.5 
 
 
351 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 
446 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.76 
 
 
442 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  37.84 
 
 
387 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.62 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.25 
 
 
430 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
283 aa  95.5  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.99 
 
 
526 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  28.92 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  40.44 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.7 
 
 
450 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  35.34 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.82 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  32.6 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.84 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.09 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.09 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.09 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.75 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.18 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  31.98 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  30.17 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.53 
 
 
448 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  42.24 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  27.91 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>