More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1182 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  100 
 
 		 450 aa  877    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.15 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  68.15 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.82 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.82 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  66.38 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  62.05 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  64.24 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  63.39 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  58.84 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  64.3 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  56.64 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  56.34 
 
 		 526 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  52.71 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  51.88 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  57.21 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  52.74 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.9 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  52.04 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.14 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  56.07 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  54.62 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.83 
 
 		 321 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 271 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  52.55 
 
 		 289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 253 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  45.42 
 
 		 251 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  54.75 
 
 		 264 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.37 
 
 		 251 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  47.23 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  48 
 
 		 251 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 232 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 251 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.12 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.77 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 257 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  52.15 
 
 		 273 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.94 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.14 
 
 		 256 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.55 
 
 		 244 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 254 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.25 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 260 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 256 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.39 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35 
 
 		 248 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.17 
 
 		 251 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.23 
 
 		 248 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.23 
 
 		 248 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.48 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.54 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  29.73 
 
 		 245 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.65 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.7 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.77 
 
 		 250 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  35.71 
 
 		 209 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  37.31 
 
 		 217 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 291 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  33.53 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  36.99 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  31.47 
 
 		 257 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.58 
 
 		 227 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.6 
 
 		 268 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32.45 
 
 		 209 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.28 
 
 		 251 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.96 
 
 		 251 aa  89.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.94 
 
 		 269 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  29.52 
 
 		 234 aa  87.8  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  37.36 
 
 		 200 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  31.77 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  29.8 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  28.4 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  31.96 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.77 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.42 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.6 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.23 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  26.58 
 
 		 245 aa  69.3  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.14 
 
 		 180 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.29 
 
 		 177 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25.64 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  28.14 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.96 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.81 
 
 		 178 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.07 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.5 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.67 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.98 
 
 		 167 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.27 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.78 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.79 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  29.12 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.58 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  28.35 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.61 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>