77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1139 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  93.8 
 
 
243 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  95.04 
 
 
243 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  45.58 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  41.63 
 
 
291 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  40.4 
 
 
256 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  36.44 
 
 
253 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
257 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.62 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.1 
 
 
255 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
251 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.99 
 
 
250 aa  105  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  33.2 
 
 
304 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.28 
 
 
257 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.53 
 
 
251 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.84 
 
 
248 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.28 
 
 
248 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  29.86 
 
 
241 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.84 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
259 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.6 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.02 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  26.75 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
431 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.17 
 
 
256 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  31.96 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  37.7 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.77 
 
 
442 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  30.73 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.04 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.49 
 
 
526 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.2 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.53 
 
 
321 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.87 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  33.62 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
271 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  27.36 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  29.77 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.49 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  29.24 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  29.96 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  26.4 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.21 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.63 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.19 
 
 
446 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  28.76 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.63 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.91 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.28 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.48 
 
 
448 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.82 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.62 
 
 
439 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  23.18 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  27.06 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.15 
 
 
450 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.06 
 
 
446 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
264 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.52 
 
 
461 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.65 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.24 
 
 
448 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.02 
 
 
455 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.67 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.02 
 
 
455 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.25 
 
 
471 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  27.32 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  22.05 
 
 
245 aa  42  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>