79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4255 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  50.19 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.27 
 
 
257 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  46.25 
 
 
251 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.53 
 
 
251 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.79 
 
 
251 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47.45 
 
 
256 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  48.22 
 
 
252 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.44 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.34 
 
 
241 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.74 
 
 
255 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
251 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  42.8 
 
 
431 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  42.13 
 
 
427 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  40.31 
 
 
431 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  42.31 
 
 
439 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  42.26 
 
 
291 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.91 
 
 
248 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
283 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.6 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.71 
 
 
248 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.8 
 
 
289 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.86 
 
 
526 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.17 
 
 
250 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
260 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.15 
 
 
251 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.49 
 
 
244 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.57 
 
 
256 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.7 
 
 
442 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
256 aa  141  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.33 
 
 
248 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.11 
 
 
423 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.78 
 
 
446 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  37.6 
 
 
271 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.15 
 
 
463 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.22 
 
 
249 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.06 
 
 
363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.94 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  37.65 
 
 
232 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.96 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.25 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.76 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.87 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  35.71 
 
 
217 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  44 
 
 
264 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.87 
 
 
257 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  49.07 
 
 
387 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  41.51 
 
 
450 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  39.37 
 
 
458 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.82 
 
 
321 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.69 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.64 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  36.4 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.31 
 
 
430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.43 
 
 
446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  35.4 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.86 
 
 
448 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  29.92 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.19 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.69 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.24 
 
 
269 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.62 
 
 
471 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.23 
 
 
455 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.23 
 
 
455 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
273 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.37 
 
 
461 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.09 
 
 
448 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  35.77 
 
 
243 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.38 
 
 
351 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  35.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  30.09 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  35.77 
 
 
243 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.73 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  26.96 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  33.05 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>