84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1836 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  66.8 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  62.93 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  55.47 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  55.87 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  49 
 
 		 388 aa  227  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  44.71 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  51.56 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  39.91 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  46.54 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  42.62 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.37 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.64 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.35 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.16 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.17 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.44 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.39 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  42.06 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.95 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.47 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.98 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  40 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.26 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.89 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  37.21 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.96 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.5 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.89 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  38.02 
 
 		 217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.1 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.68 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.43 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.6 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.45 
 
 		 463 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.28 
 
 		 362 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.07 
 
 		 442 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.17 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  38.2 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.28 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  28.4 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.86 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  48.09 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  39.79 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.69 
 
 		 526 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  38.25 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  48.46 
 
 		 430 aa  95.1  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  37.95 
 
 		 439 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  36.25 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.18 
 
 		 446 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.39 
 
 		 448 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.6 
 
 		 450 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.62 
 
 		 446 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  35.2 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.75 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.93 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.27 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.94 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  40.3 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.64 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  34.88 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  36.4 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0771  hypothetical protein  21.99 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  22.33 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0936  hypothetical protein  23.3 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.112147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  22.82 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  23.68 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>