82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0415 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  100 
 
 		 256 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  60.78 
 
 		 252 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  45.35 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.3 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  52.52 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.25 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.94 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  47.45 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.37 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.42 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.58 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.76 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.59 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  45.77 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.76 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.78 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  41.2 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.16 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  43.72 
 
 		 431 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  43.53 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.86 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  36.8 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.54 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.6 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.45 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  40 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.02 
 
 		 362 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.88 
 
 		 442 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.58 
 
 		 363 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.24 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  40.8 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.06 
 
 		 423 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.62 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.18 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.02 
 
 		 526 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  40.4 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.54 
 
 		 463 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.52 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  42.91 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 387 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  41.8 
 
 		 450 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.52 
 
 		 425 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.73 
 
 		 446 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.11 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  41.52 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  41.7 
 
 		 427 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  36.25 
 
 		 388 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  37.34 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.06 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  35.57 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  45.74 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.8 
 
 		 446 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.43 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  42.8 
 
 		 458 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.04 
 
 		 439 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  40.4 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.43 
 
 		 430 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.29 
 
 		 448 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  30.33 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.43 
 
 		 471 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.71 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.71 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  31.1 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  42.91 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.43 
 
 		 448 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.57 
 
 		 461 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.54 
 
 		 351 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  28.87 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.7 
 
 		 375 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  32 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  28.95 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  23.91 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  25.31 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  21.93 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>