21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1009 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0936  hypothetical protein  95.97 
 
 		 306 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.112147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  94.3 
 
 		 298 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  82.87 
 
 		 289 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0771  hypothetical protein  68.4 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  27.8 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.09 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.8 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  25.64 
 
 		 388 aa  49.3  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  23.94 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  23.53 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.92 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  26.03 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  23.49 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  32.35 
 
 		 450 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  24.4 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  27.59 
 
 		 448 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>